A doutrina da Congregação de Macapá da IPCPA é conservadora e genuinamente reformada. Os reformadores empregaram cinco expressões latinas para resumir o que criam. Nós as adotamos:
Sola Scriptura (só a Escritura). As Escrituras são a autoridade suprema pela qual todas as questões doutrinárias e eclesiásticas devem ser decididas (Dt 4.2). Essa doutrina é importantíssima para a preservação e para a purificação da igreja.
Solo Christi (só Cristo). Não temos nenhum outro mediador pelo qual o homem seja reconciliado com Deus, a não ser Cristo, a segunda pessoa da Trindade (1 Tm 2.5), o Cordeiro de Deus que tira o pecado do mundo (Jo 1.29).
Sola Gratia (só a graça). Cremos que a salvação do homem não decorre de nenhum tipo de boas obras que ele venha realizar, mas sim do favor imerecido de Deus (Rm 3.20,24,28).
Sola Fide (só a fé). O meio pelo qual a ação regeneradora do Espírito Santo é aplicada ao coração humano é a fé. Nenhum homem pode ser salvo, a não ser que creia na eficácia da obra de Cristo, confiando-se inteira e exclusivamente a ele (Rm 1.17; Ef 2.8-9).
Soli Deo Gloria (só a Deus glória). Cremos em um Deus absolutamente soberano, Senhor da História e do Universo, “que faz todas as coisas segundo o conselho da sua vontade” (Ef 1.11). Cremos que o fim principal do homem e da religião não é o bem-estar, a saúde física, a prosperidade, a felicidade, ou mesmo a salvação do homem. É, sim, a glória de Deus, pois Ele não existe para satisfazer as necessidades do homem; o homem é que foi criado para o louvor da glória de Deus (Rm 11.36; Ef 1.6-14).